Ему на вид 16 лет, однако он не умеет говорить, не может есть и пить, и у него отсутствует пупок, что говорит о том, что он не был рожден, как все обычные люди. Психолог Николь Трегер берет мальчика к себе домой и дает ему имя Кайл. И чем дольше новоиспеченный член семьи живет в своем новом доме, тем яснее окружающие понимают, что мальчик обладает способностями, кажущимися сверхъестественными.
     Его жизнь — школа, и учится он довольно быстро. Он прыгает с крыши, обладает огромной силой, за несколько часов запоминает весь объем школьных знаний, влюбляется в девушку из соседнего дома, Аманду Блум. Его никто не ищет, но за ним следят. И вскоре он это понимает; так он «знакомится» с Томом Фоссом, его телохранителем. Он и привел Кайла к Адаму Бейлину, биологическому отцу Кайла, клоном которого Кайл и является.
     Адам многому учит Кайла, и Кайл понимает, что у него огромный потенциал. Но потом, Адам рассказывает, что развитие должно идти гармонично, то есть разум и физическое состояние должны идти рядом. И к сожалению Адам это слишком поздно понял. Позже Адама убивают: в Зиззикс их выследили. Фосс взрывает секретную лабораторию Зиззикс и отправляет Кайла к Трегерам, так как это единственный шанс для него жить в семье.
     Трегеры приняли Кайла нормально. Кайл по началу противился Фоссу и не хотел тренироваться, следуя его приказам. Но позже ему стали являться видения.
     В этот же момент, или даже чуть раньше, появляется новый объект, который выжил при взрыве Зиззикса. Это 781228, далее Джесси. Она подверглась попытке физического и сексуального насилия и невольно убила человека. Джесси и Кайл сразу почувствовали некую связь между ними. На горизонте появляется новый враг, компания-магнат Мадакорп, прародитель секретной лаборатории Зиззикс. Они обманом внедряют Джесси в семью Кайла, устраивают отца семейства Трегеров к себе на работу, и полностью разрушают доверие и понимание в семье...

Wikipedia®

     Игра начинается после того, как Джесси и Кайл нашли домик в лесу, где находится раненный Адам. Проникнув в мозг Кайла, девушка получила то, к чему стремилась, - узнала информацию, в которой так нуждается Мадакорп. Джесси убегает от Кайла и прыгает со скалы...